Различают: генитальный эндометриоз - затрагивает органы половой системы и эстрагенитальный - затрагивает любые другие органы. В настоящее время нет четкой, единой теории развития эндометриоза. При этом каждая из существующих теорий имеет право на существование и объясняет тот или иной этап формирования эндометриоидного процесса.